Le musée se divise en trois espaces aux collections bien précises :
- Dans l’espace principal se trouve l’exposition permanente, ouverte depuis 1991 & l’exposition temporaire au RDC (jusqu’au 30 avril 2019).
- Dans l’annexe de la Stèle Kaba, une exposition est dédiée à ce héro de la résistance face à la colonisation.